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随后，小智他们来到了和辉的秘密基地，只是现在秘密基地里一片狼藉，桌椅等等都被损坏了，墙上还开了一个大洞，向着里面延伸而去。
“啊！我的秘密基地被破坏了！”(?﹏?)和辉伤心道。
“太过分了！”
“是谁干这种事的？！”
“对了，土居忍士，你在哪里啊？”和辉开始担心起自己的土居忍士。
“我们进去看看吧！说不定有收获！”小智指着隧道提议道。
随后，小智等人走进隧道，走了一会儿后，来到了一处空旷的地方，里面耸立着一座座高高的建筑物！
“没想到，在洞窟后面有这样的大遗迹。”小田卷博士感叹道。
轰！！
众人向爆炸声发出的方向看去，看到下方的一座建筑物旁站着一个穿着红色制服，带着大狼犬的男人，还有穿着蓝色潜水服的五个人，水中有一只利牙鱼。
“是火岩队与水舰队，他们来这做什么？”小智认出那制服是曾经被自己送进监狱的火岩队与水舰队的成员一样。小智也想起了这段剧情，这遗迹并没有什么用，在动画也仅仅为了引出火岩队与水舰队的目的而已。
“辛苦你们了，谢谢帮忙，火岩队。”水舰队领队的女子嘲讽道。
“水舰队，果然真的是你们。”火岩队领队的男子说道。
“这里就留给我来处理，各位就请先走吧，要尽量避免无谓的战斗，以确实执行任务为优先。”女子下令道。
随后，水舰队的人也跑进建筑物里搜查了起来。
“火村行动队长，由你亲自出动这件事情来看，火岩队一定很看重这个遗迹啊！”女子调侃道。
“作战队长泉美，你应该很庆幸这个地方有水，你才能使用最得意的利牙鱼。”火村反驳道。
“搞不好还可以教你的大狼犬游泳呢！”泉美笑着回应。
“呵，要试试看吗！”火村毫不示弱。
两人虽然针锋相对，但也没真的打起来。
另一边正在观察的小智一行人，小遥看着开口道：“他们的关系好像很恶劣的样子！”
“这两个名字我听说过，足利用神奇宝贝干坏事的人，不过，他们到这个遗迹来想干什么呀？”小田卷博士开口道。
“我们先静观其变，他们人太多了，看看他们想做什么，然后再做打算吧！”小智提议道。主要是主力都不在身边，上去这不是送死吗？！
众人点头同意。
这时火村拿出对讲机道：“这里是火焰1号，内部被海洋队的人侵入了？没关系！继续执行任务。”
“是。”
火村对着泉美问道：“如果没有你们要的，而只有我们追寻的力量的话呢！”
泉美也笑着看着火村问道：“我也要问你同样的问题，就算这里存在着你或我们追寻的力量，你们有办法掌控吗！”
“难不成，你带红色的珠子来了！”火村冷笑道。
泉美则试探道：“有的话，你想怎么样呢？”
“那当然是...”火村上前，只要泉美答是，火村直接发起总攻。
两人对峙了一会儿，泉美先退让一步：“哼！非常的遗憾，我还没有资格碰那个东西，估计你也还没有资格拿出那个...蓝色的珠子吧。”
不会飞的朱红色宝珠与胖头鱼的靛蓝色宝珠吗？！不！应该不是，对应的不对，应该只是可以控制它们的珠子而已！看来两大组织已经得到了控制它们的珠子，这是在找唤醒它们的地方，不过一群井底之蛙，海洋与大地哪有天空强，要选也是选烈空坐，小智不屑的想道。