待众人来到了大海之上，船只却停了下来，“小遥，把玛纳霏放到海中吧！在这之后，要让玛纳霏自己决定要走的道路！”
作为沧海的王子玛纳霏属于大海，更重要的是寻找海之神殿需要玛纳霏来引路。
“没错，我们能做的事情，就只有在一旁守护着它而已！”这时杰克也道。
小遥点了点头，将玛纳霏放回了大海中，玛纳霏入海如鱼得水般，欢呼雀跃的海中遨游！
小智见状便将自己的六只水系神奇宝贝们放了出来，相信有它们在，即便幽灵船长再搞偷袭也很难成功。
而小智一行人则来到了船舱底层，在这里的窗口可以看到海中的美景，各种海洋神奇宝贝成群结队的从中遨游，玛纳霏与水箭龟它们的身影也出现在眼前。
在海洋的畅游的玛纳霏看到小遥的身影高兴的撞了过来，砸在了玻璃上，可把小遥吓坏了！
看着小家伙疼哭的小表情，小遥隔着玻璃哄它，“乖乖，不痛，不痛哦！”
在小遥的声音下，玛纳霏顿时不哭了，高兴的游来游去，凭着本能，感应着海之神殿的位置。
“玛纳霏就是这样，独自一个在广大的海中洄游，游到过去的栖息地，也就是海之神殿！”
天色渐暗，玛纳霏回到船上，在小遥的照顾下熟睡过去。
广美的爷爷思普与爸爸凯站在甲板上看着天空的月亮，“月全蚀的日子就快要来临了，要是时机吻合的话，说不定我们也有机会见到海之神殿！”
“就像过去的水之民一样，说不定我们也会得到海之祝福！”凯憧憬道。
翌日，玛纳霏继续在海中畅游，而杰克则乘坐的滑翔翼在高空中巡察。
就在这时一群吼鲸王露出水面，正在跟着船只航行，而玛纳霏正坐在其中一只吼鲸王上。
当天夜晚，小遥与玛纳霏同床共眠，玛纳霏更是喜提新词“喜欢！”
又是一天，这次小智一行人遇到了乘龙族群！
“皮卡皮～”皮卡丘指着乘龙的首领激动的叫喊着。
“皮卡丘，怎么了？”小智疑惑的问道。
“皮卡～皮卡～”
“难道？”小智看向那只乘龙，大喊道，“唉～乘龙！”
“呜～”乘龙也发现了小智，高兴的叫喊着。
接着小智抱着皮卡丘跳了下去，“啊？！小智！”小遥见状惊叫道。
只见跳下去的小智被乘龙接住，小智抱着乘龙高兴道，“好久不见，乘龙！”
“皮卡～”皮卡丘站在乘龙头顶高兴道。
“呜～”乘龙见到小智也十分开心，载着小智在海上遨游。
“原来是小智的那只乘龙啊！”小刚见状恍然大悟，伊布则无奈的看着自己的训练家就这样抛弃自己而去了。
“小智也有乘龙吗？”小遥惊讶道。
小刚点点头，“是在橘子群岛收服的，不过当时我没有跟着小智旅行。”
说到小刚突然顿了顿好像想到了什么不好的经历，“咳咳！好像为了让它回归族群放生了，我也只见过一次！”
小遥到没看出小刚的异状，明悟的点点头。
这一整天，小智一行人与乘龙族群正并而行，但终究离别的时刻还是来临了！
“呜～”乘龙不舍的与小智道别。
“再见了，乘龙！”“皮卡皮～”小智与皮卡丘站在船板上与乘龙告别。
乘龙回到了族群中，而乘龙的父母也围了上来，它们看得出来它们的孩子似乎很喜欢那个人类，现在孩子长大，可以选择自己的未来了！